عفونتهای قارچی سیستمیک و مخاطره‌آمیز ناشی از ارگانیسمهای حساس؛ اندوکاردیت قارچی؛ سپتی‌سمی قارچی
بالغین و کودکان: بعضی از متخصصین توصیه می‌کنند که ابتدا 1 mg از آمفوتریسین B در 250 ml از محلول DW 5% رقیق و درخلال 2 تا 4 ساعت از راه انفوزیون وریدی تجویز شود. در صورت تحمل این دوز توسط بیمار، روز بعد 5 mg آمفوتریسین B را در 500 ml از محلول DW 5% رقیق کرده و تزریق می‌کنیم. در صورت تحمل بیمار میتوان روزانه 5-10 mg به دوز دارو اضافه نمود. دورة درمان بستگی به شدت و طبیعت عفونت دارد.
هیستوپلاسموز، کریپتوکوکوز و بلاستومایکوز: نیاز به دوز تام وریدی 2-4 g دارند.
اسپوروتریکوز: 20 mg در روز از راه وریدی، حداکثر به مدت 9 ماه تجویز می‌شود.
آسپرژیلوز: نیاز به دوز تام وریدی 3.6 g در مدت 11 ماه دارد.
هیستوپلاسموز ریوی مزمن: نیاز به دوز تام وریدی 35 mg/kg دارد. ولی ممکن است حتی تا 40 mg/kg نیز مورد نیاز باشد.
لیشمانیوز جلدی ـ مخاطی
بالغین و کودکان: روزانه 0.25-0.5 mg/kg از راه وریدی تجویز می‌شود. سپس دوز دارو به 0.5-1 mg/kg در روز افزایش می‌یابد. دورة درمان 12-6 هفته است.
لیشمانیوز احشایی
بالغین و کودکان: 3 mg/kg از راه وریدی در روزهای 1-5 و 14 و 21 تجویز می‌شود.
آرتریت کوکسیدیوایدال
بالغین: 5-3 mg به داخل فضای مفصلی تزریق می‌شود.